De nieuwste zelfstandige versie van MS-DOS is 6.22. Microsoft Windows 95 en 98 bevatten een versie van MS-DOS die bekend staat als 7.0. MS-DOS 7.0 kan binnen Microsoft Windows worden gebruikt, maar kan niet als een zelfstandige versie worden gekocht.

De Windows-opdrachtprompt (MS-DOS 7.0) kan veel van de opdrachten uitvoeren die beschikbaar zijn in eerdere versies van MS-DOS. Sommige van de opdrachten zijn echter niet langer beschikbaar in MS-DOS 7.0. Als een opdracht niet beschikbaar is in MS-DOS 7.0 (Windows 95 en hoger), kan er nog steeds naar worden verwezen op onze MS-DOS-helppagina. Als een opdracht niet beschikbaar is in MS-DOS 7.0, is er bovendien geen methode om oude MS-DOS-opdrachten in MS-DOS 7.0 te laten werken.